[1]惠朋利,朱社教,王成,等.基于生物信息学探讨葛根芩连汤治疗溃疡性结肠炎的可行性[J].现代中医药,2024,(01):095-101.[doi:10.13424/j.cnki.mtcm.2024.01.020]
　HUI Pengli,ZHU SheJiao,WANG Cheng,et al.Exploring the Feasibility of Gegen Qinlian Decoction in Treating Ulcerative Colitis Based on Bioinformatics[J].Modern Traditional Chinese Medicine,2024,(01):095-101.[doi:10.13424/j.cnki.mtcm.2024.01.020]
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基于生物信息学探讨葛根芩连汤治疗溃疡性结肠炎的可行性()
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《现代中医药》[ISSN:1006-6977/CN:61-1281/TN]

卷:
期数:
2024年01期
页码:
095-101
栏目:
出版日期:
2024-01-20

文章信息/Info

Title:
Exploring the Feasibility of Gegen Qinlian Decoction in Treating Ulcerative Colitis Based on Bioinformatics
文章编号:
1672-0571(2024)01-0095-07
作者:
惠朋利; 朱社教; 王成; 谢红; 沈维艳; 王谧; 张涛; 邹崇伟; 高宏君; 曾红梅
安康市中医医院，陕西 安康 710000
Author(s):
HUI Pengli; ZHU SheJiao; WANG Cheng; XIE Hong; SHEN Weiyan ; WANG Mi; ZHANG Tao; ZOU Chongwei; GAO Hongjun; ZENG Hongmei
Ankang Traditional Chinese Medicine Hospital,Shaanxi Ankang 710000,China
关键词:
关键词：葛根芩连汤; 湿热证; 溃疡性结肠炎; 中医; 网络药理学; 作用机制
Keywords:
Key words:Gegen Qinlian decoction; Damp heat syndrome; Ulcerative colitis; Traditional Chinese medicine; Network pharmacology; Mechanism of action
分类号:
R285.5
DOI:
10.13424/j.cnki.mtcm.2024.01.020
文献标志码:
A
摘要:
摘要：目的 基于生物信息学探讨葛根芩连汤（GGQL）治疗溃疡性结肠炎（UC）的作用靶点及作用机制。方法 检索TCMSP数据库得到方剂中各药物的有效成分及靶基因；再检索OMIM数据库、DisGeNET数据库获得疾病的基因，将药物基因与疾病基因取交集得到核心基因；采用STRING数据库构建基因功能关联网络；采用DAVID数据库进行GO富集分析和通路富集分析。结果 共获得有效成分278种，靶点410个，疾病基因914个；将药物基因与疾病基因取交集共得到113个核心基因，然后采用STRING数据库构建基因功能关联网络，将网络信息数据导入Cytoscape软件进行拓扑分析发现IL6、STAT3、IL1B、VEGFA、MAPK1、EGF、PTGS2、EGFR、ICAM1、MMP9等靶点度值较高，可能是核心靶点；使用DAVID数据库对靶点进行GO富集分析共得到16个富集的生物过程聚类，通路富集分析共获得26个富集的通路聚类，其中与炎症密切相关并且联系靶点较多的通路有TNF信号通路和炎症性肠病信号通路。结论 研究初步得到了GGQL治疗UC的作用靶点以及作用通路，结合已发表的相关研究认为GGQL可能通过TNF信号通路发挥作用。
Abstract:
Abstract：Objective Based on bioinformatics，to explore the target and mechanism of action of Gegen Qinlian decoction (GGQL) in the treatment of ulcerative colitis (UC).Methods Retrieve the TCMSP database to obtain the effective ingredients and target genes of each drug in the formula；Retrieve the OMIM database and DisGeNET database to obtain disease genes，and intersect drug genes with disease genes to obtain core genes；Then，a gene function association network was constructed using the STRING database；Finally，the DAVID database was used for GO enrichment analysis and pathway enrichment analysis.Results As a result，a total of 278 effective ingredients，410 targets，and 914 disease genes were obtained；A total of 113 core genes were obtained by intersecting drug genes with disease genes.Then，a gene functional association network was constructed using the STRING database.The network information data was imported into Cytoscape software for topology analysis，and it was found that IL6，STAT3，IL1B，VEGFA，MAPK1，EGF，PTGS2，EGFR，ICAM1，MMP9 and other target values were high，which may be core targets；Using the DAVID database for GO enrichment analysis of targets，a total of 16 enriched biological process clusters were obtained，and 26 enriched pathway clusters were obtained through pathway enrichment analysis.Among them，the pathways closely related to inflammation and closely related to targets include the TNF signaling pathway and inflammatory bowel disease signaling pathway.Conclusion The preliminary study has identified the target and pathway of GGQL in the treatment of UC，and combined with relevant published studies，it is believed that GGQL may play a role through the TNF signaling pathway.

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更新日期/Last Update: 2024-01-27